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European ancestry and polymorphisms in DNA repair genes modify the risk of melanoma: A case-control study in a high UV index region in Brazil

GONCALVES, Fernanda T.; FRANCISCO, Guilherme; SOUZA, Sonia P. de; LUIZ, Olinda C.; FESTA-NETO, Cyro; SANCHES, Jose A.; CHAMMAS, Roger; GATTAS, Gilka J. F.; ELUF-NETO, Jose
Fonte: ELSEVIER IRELAND LTD Publicador: ELSEVIER IRELAND LTD
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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66.21%
Background: UV radiation is the major environmental factor related to development of cutaneous melanoma. Besides sun exposure and the influence of latitude, some host characteristics such as skin phototype and hair and eye color are also risk factors for melanoma. Polymorphisms in DNA repair genes could be good candidates for susceptibility genes, mainly in geographical regions exposed to high solar radiation. Objective: Evaluate the role of host characteristic.; and DNA repair polymorphism in melanoma risk in Brazil. Methods: We carried out a hospital-based case-control study in Brazil to evaluate the contribution of host factors and polymorphisms in DNA repair to melanoma risk. A total of 412 patients (202 with melanoma and 210 controls) were analyzed regarding host characteristics for melanoma risk as well as for 11 polymorphisms in DNA repair genes. Results: We found an association of host characteristics with melanoma development, such as eye and hair color, fair skin, history of pigmented lesions removed, sunburns in childhood and adolescence, and also European ancestry. Regarding DNA repair gene polymorphisms, we found protection for the XPG 1104 His/His genotype (OR 0.32; 95% CI 0.13-0.75), and increased risk for three polymorphisms in the XPC gene (PAT+; IV-6A and 939Gln)...

Efficiency of the DNA repair and polymorphisms of the XRCC1, XRCC3 and XRCC4 DNA repair genes in systemic lupus erythematosus

BASSI, C. L.; XAVIER, D. J.; PALOMINO, G. M.; NICOLUCCI, P.; SOARES, C. P.; SAKAMOTO-HOJO, E. T.; DONADI, E. A.
Fonte: SAGE PUBLICATIONS LTD Publicador: SAGE PUBLICATIONS LTD
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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66.28%
Impaired DNA repair efficiency in systematic lupus erythematosus (SLE) patients has been reported ill some studies, mainly regarding the repair of oxidative damage, but little is known about repair kinetics towards primarily single-stranded DNA breaks. In the present study, we aimed to investigate: (a) the efficiency of SLE peripheral blood leucocytes in repairing DNA damage induced by ionizing radiation and (b) the association of DNA repair gene (XRCC1 Arg399Gln, XRCC3 Thr241Met and XRCC4 Ile401Thr) polymorphisms in SLE patients, considering the whole group, or stratified sub-groups according to clinical and laboratory features. A total of 163 SLE patients and 125 healthy control were studied. The kinetics of DNA strand break repair was evaluated by the comet assay, and genotyping for DNA repair genes was performed by PCR-RFLP. Compared with controls. SLE leucocytes exhibited decreased efficiency of DNA repair evaluated at 30 min following irradiation. A significant association with DNA repair gene polymorphisms was not observed for the whole group of SLE patients; however, the XRCC1Arg399Gln polymorphism was associated with the presence of anti-dsDNA antibody. The concomitance of two DNA repair polymorphic sites was associated with the presence of neuropsychiatric manifestations and antiphospholipid antibody syndrome. Taken together...

DNA damage induced by the anthracycline cosmomycin D in DNA repair-deficient cells

CARVALHO, Helotonio; GARRIDO, Leandro M.; FURLAN, Renata L. A.; PADILLA, Gabriel; AGNOLETTO, Mateus; GUECHEVA, Temenouga; HENRIQUES, Joao A. P.; SAFFI, Jenifer; MENCK, Carlos Frederico Martins
Fonte: SPRINGER Publicador: SPRINGER
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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66.18%
Anthracyclines have been widely used as antitumor agents, playing a crucial role in the successful treatment of many types of cancer, despite some side effects related to cardiotoxicity. New anthracyclines have been designed and tested, but the first ones discovered, doxorubicin and daunorubicin, continue to be the drugs of choice. Despite their extensive use in chemotherapy, little is known about the DNA repair mechanisms involved in the removal of lesions caused by anthracyclines. The anthracycline cosmomycin D is the main product isolated from Streptomyces olindensis, characterized by a peculiar pattern of glycosylation with two trisaccharide rings attached to the A ring of the tetrahydrotetracene. We assessed the induction of apoptosis (Sub-G(1)) by cosmomycin D in nucleotide excision repair-deficient fibroblasts (XP-A and XP-C) as well as the levels of DNA damage (alkaline comet assay). Treatment of XP-A and XP-C cells with cosmomycin D resulted in apoptosis in a time-dependent manner, with highest apoptosis levels observed 96 h after treatment. The effects of cosmomycin D were equivalent to those obtained with doxorubicin. The broad caspase inhibitor Z-VAD-FMK strongly inhibited apoptosis in these cells, and DNA damage induced by cosmomycin D was confirmed by alkaline comet assay. Cosmomycin D induced time-dependent apoptosis in nucleotide excision repair-deficient fibroblasts. Despite similar apoptosis levels...

DNA repair mechanisms protect our genome from carcinogenesis

Strano Moraes, Maria Carolina; Cabral Neto, Januario Bispo; Menck, Carlos Frederico Martins
Fonte: FRONTIERS IN BIOSCIENCE INC; IRVINE Publicador: FRONTIERS IN BIOSCIENCE INC; IRVINE
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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66.24%
Human cells are constantly exposed to DNA damage. Without repair, damage can result in genetic instability and eventually cancer. The strong association between the lack of DNA damage repair, mutations and cancer is dramatically demonstrated by a number of cancer-prone human syndromes, such as xeroderma pigmentosum (XP), ataxia-telangiectasia (AT) and Fanconi anemia (FA). This review focuses on the historical discoveries related with these three diseases and describes their impact on the understanding of DNA repair mechanisms and the causes of human cancer. As deficiencies in DNA repair are also often related with progeria symptoms, unrepaired damage and aging are somehow related. Several other pathologies associated with DNA repair defects, genetic instability and increased cancer risk are also discussed. In fact, studies with cells from these many syndromes have helped in understanding important levels of protection against cancer and aging, although little help has actually been conferred to the patients in terms of therapy. Finally, the recent advances in combined basic and translational research on DNA repair and chemotherapy are presented.; FAPESP (Sao Paulo, Brazil); FAPESP (Sao Paulo, Brazil); CNPq (Brasilia, Brazil); CNPq (Brasilia...

Modulação da expressão do gene de reparo de DNA xpa por meio de vetores genéticos em células humanas; XPA DNA repair gene modulation in human cell lines by genetic vectors

Muotri, Alysson Renato
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 19/04/2001 Português
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A integridade do DNA é ameaçada pelos efeitos lesivos de inúmeros agentes físicos e químicos que podem vir a comprometer sua função. Um dos mais versáteis e estudados mecanismos de reparo de DNA é o reparo por excisão de nucleotídeos (NER). Este mecanismo remove lesões que causam distorções na dupla fita de DNA, incluindo dímeros de pirimidina ciclobutano (CPDs) e 6-4 fotoprodutos (6-4 PPs), provocados pela radiação de luz ultravioleta (UV). Em humanos, a síndrome genética xeroderma pigmentosum (XP) apresenta uma alta sensibilidade à luz solar, resultando em um grande aumento na incidência de tumores em regiões expostas da pele e degeneração neurológica progressiva. O gene xpa parece estar envolvido diretamente no reconhecimento de lesões produzidas pela luz UV, atuando tanto no reparo global (GGR) como no reparo acoplado à transcrição (TCR). A modulação da expressão deste gene deve alterar as taxas de reparo no genoma celular, fornecendo valiosa contribuição para o estudo do reparo de DNA no NER e em outras vias distintas. No entanto, não foi possível a atenuação ou inativação total do transcrito XPA, provavelmente devido ao baixo número de moléculas de mRNA nas células e da relativa estabilidade da proteína XPA. A expressão controlada do cDNA xpa em células deficientes XP12RO foi conseguida através da transfecção do vetor indutível por muristerona A...

Modulação da expressão de genes de reparo do DNA em células humanas irradiadas com raios gama sob diferentes taxas de dose; Modulation of the expression of DNA repair genes in human cells irradiated with gamma rays at different dose rates

Merchi, Igor Magela
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 05/12/2007 Português
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66.22%
As radiações ionizantes (RI) são amplamente utilizadas na área médica, principalmente para diagnóstico e terapia. Uma vez que a exposição às radiações implica em sérias complicações para a saúde humana e para o meio ambiente, torna-se relevante a compreensão dos mecanismos moleculares que coordenam as respostas em diferentes tipos celulares, especialmente em células normais. A taxa de dose (TD) é um importante fator a ser considerado em radiobiologia, com base em alguns estudos sobre a sua influência nas respostas celulares. Nesse contexto, duas TD distintas (0,5 e 2,0Gy/min) foram testadas para verificar a influência da TD na expressão gênica e protéica em fibroblastos e linfócitos humanos. Fibroblastos primários em estado de confluência foram irradiados com 4Gy e linfócitos com 2 Gy, sob as TDs de 0,5 e 2,0 Gy/min. Em fibroblastos, o RNA foi coletado 6 h após a irradiação, tempo em que foram analisados os níveis de expressão gênica pelo método de microarranjos de cDNA e, para alguns genes de reparo do DNA e algumas proteínas (H2AX, PCNA e FEN1) a expressão foi analisada por qPCR e Western blot, respectivamente, em ambos os tipos celulares, 2 e 6 h após a irradiação. A análise de expressão gênica por microarranjos de cDNA efetuada pelo programa SAM revelou 94 genes (FDR < 0.05) induzidos sob a TD de 0...

Proteínas e polimorfismos de genes de reparo de DNA na fotocarcinogênese em lábio; Proteins and polymorfism of DNA repair genes in lip photocarcinogenesis

Ricardo, Patricia Leite de Godoi Adachi
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 27/08/2009 Português
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66.19%
O carcinoma epidermóide de lábio (CEL) e a queilite actínica (QA) são condições que atingem o vermelhão do lábio e são causadas pela exposição crônica e excessiva à radiação ultravioleta (UV) do sol. A absorção da radiação UV produz dois tipos predominantes de danos ao DNA, os dímeros de pirimidina-ciclobutanos (CPD) e os fotoprodutos 6-4 pirimidina-pirimidona (6-4PP). Se não forem reparadas estas lesões induzidas por UV podem dar lugar a mutações em seqüências de DNA. Essas mutações compreendem a transição CT e CC TT em seqüências dipirimidínicas, conhecidas como mutações com assinatura UV. CPDs e 6-4PPs são primariamente reparadas por um sistema de reparo de DNA chamado reparo por excisão de nucleotídeo (NER). Polimorfismos presentes em genes do NER podem gerar maior susceptibilidade ao desenvolvimento de vários tipos de câncer, incluindo o câncer de pele. O presente trabalho teve por objetivos: realizar levantamento epidemiológico de pacientes com QA e CEL bem como avaliar seus hábitos de exposição solar; verificar se os polimorfismos genéticos XPD (Asp312Asn) e XPD (Lys751Gln) estão relacionados com risco para o desenvolvimento de QA e verificar a expressão imunoistoquímica das proteínas XPC...

O papel da proteína SET no perfil de metilação do miR-9 e no reparo de DNA em células humanas de carcinoma espinocelular oral; The role of SET protein in miR-9 methylation profile and DNA repair in human oral squamous cell carcinoma

Tannous, Maryna Aguilar
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 03/10/2014 Português
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O início e a progressão do carcinoma espinocelular oral (CEO) são caracterizados pela aquisição de alterações genéticas e epigenéticas. A proteína SET é descrita como uma oncoproteína e, recentemente, o seu acúmulo foi mostrado em CEO. Diversas funções têm sido atribuídas à SET, tais como controle do ciclo celular, sobrevivência celular, migração celular, acetilação de histonas, e resposta ao estresse oxidativo. Este contexto sugere a SET como alvo terapêutico, mas primeiramente, é essencial entender a sua ação na tumorigênese e progressão em CEO. A hipótese central no presente estudo refere-se ao papel da SET na instabilidade genômica e reparo de DNA, bem como na regulação epigenética da expressão de miRNA, com impacto no desenvolvimento e progressão de CEO. O silenciamento estável de RNA foi realizado usando plasmídeo contendo short hairpin RNA contra SET (shSET) em linhagens de CEO in vitro (HN12 e Cal27) e in vivo (tumores xenoenxerto de HN12). Efeitos da redução da SET em CEO, in vitro e in vivo, foram avaliados no perfil de metilação (MSP, methylation specific PCR), expressão de miR-9 (qRT-PCR) e reparo de DNA (reparo mismatch e de quebra de fita dupla - DSB). A instabilidade genômica foi abordada por meio de cinco microssatélites (PCR convencional) para avaliar a instabilidade de microssatélites (MSI)...

Eixo p53-hHR23B-XPC na modulação das vias de reparo de DNA em melanomas: Evidências para processos de carcinogênese, progressão e quimioresistência; p53-hHR23B-XPC axis modulates DNA repair pathways in melanomas: Evidences to carcinogenesis, progression and chemoresistance process

Francisco, Guilherme
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 20/02/2015 Português
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66.25%
O reparo de lesões genômicas tem papel critico na supressão da transformação maligna. Para melanomas, tipo de câncer de pele, lesões causadas por UV são responsáveis pela aquisição do fenótipo maligno. A via de reparo por excisão de nucleotídeos (NER) exerce função importante na correção destas lesões, sendo na proteína XPC um dos seus principais agentes atuantes no reconhecimento das lesões. Enquanto mutações em XPC predispõem à Xeroderma Pigmentosum, modulações na função de XPC podem exercer papel critico na aquisição de mutações UV em melanomas esporádicos. A modulação pode ocorrer por ação transcricional, interação proteica ou também por fatores genéticos que possam interferir com sua expressão e/ou atividade. Para entender o papel da transcrição na modulação do reparo exercido por XPC, verificou-se o papel de p53 neste contexto. Comparando-se linhagens com diferentes status funcionais de p53 frente a lesões UVB, os resultados indicaram seu papel quanto a diferenças na sensibilidade à exposição, expressão de proteínas de reparo e cinética de reparo de lesões CPD. Além disso, caracterizou-se a expressão de proteínas envolvidas com apoptose e a ativação de caspase 3/7, além da expressão de espécies reativas de oxigênio produzidas após UVB...

Perfis de Expressão Gênica e Possíveis Interações entre microRNAs e mRNAs em Diabetes Mellitus Tipo 1 com Enfoque em Resposta ao Estresse Oxidativo e Reparo do DNA; Gene Expression Profiles and Possible Interactions between microRNAs and mRNAs in Type 1 Diabetes Mellitus, Focusing on Response to Oxidative Stress and DNA Repair

Takahashi, Paula
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 23/03/2015 Português
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O Diabetes Mellitus tipo 1 (DM1) resulta de um ataque autoimune contra as células pancreáticas, extinguindo a produção de insulina e levando à hiperglicemia. Evidências indicam uma associação entre o estresse oxidativo (que pode causar danos no DNA) e o DM1, sendo que apenas alguns trabalhos da literatura relataram a expressão de genes relacionados à respostas ao estresse oxidativo e reparo do DNA em DM1. Ainda, os microRNAs (reguladores pós-transcricionais da expressão gênica) estão envolvidos em vários processos biológicos e condições patológicas, mas informação sobre a expressão dos microRNAs em DM1 ainda é escassa. A fim de proporcionar um melhor entendimento sobre as vias de regulação de genes participantes de processos biológicos relevantes para o DM1, o presente estudo consistiu em analisar os perfis de expressão gênica (método de microarranjos) de microRNAs e de mRNAs (bem como de algumas proteínas) provenientes de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs, do inglês peripheral blood mononuclear cells) de pacientes DM1 (n=19) em comparação com indivíduos sadios não diabéticos (n=11), dando maior enfoque a genes associados à resposta ao estresse oxidativo e reparo do DNA. Os resultados de expressão obtidos pelo método de microarranjos apontaram 44 microRNAs diferencialmente expressos (35 induzidos e nove reprimidos) nos pacientes DM1 e esses microRNAs apresentaram grande especificidade ao estratificar pacientes DM1 dos controles...

Measuring oxidative DNA damage and DNA repair using the yeast comet assay

Azevedo, F.; Marques, Filipe; Fokt, Hanna; Oliveira, Rui Pedro Soares de; Johansson, Björn
Fonte: John Wiley & Sons Publicador: John Wiley & Sons
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em //2011 Português
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66.21%
Chromosomal DNA damage can be a result of several processes and agents of endogenous or exogenous origin. These cause strand breaks or oxidized bases that lead to strand breaks, which relax the normally supercoiled genomic DNA and increase its electrophoretic mobility. The extent of DNA damage can be assessed by single cell gel electrophoresis, where the chromosomal DNA migration distance correlates with the extent of DNA damage. This technique has been used for a variety of applications with several organisms, but only a few studies have been reported for Saccharomyces cerevisiae. A possible reason for this absence is that low cellular DNA content could hamper visualization. Here we report an optimization of the comet assay protocol for yeast cells that is robust and sensitive enough to reproducibly detect background DNA damage and oxidative damage caused by hydrogen peroxide. DNA repair was observed and quantified as diminishing comet tail length with time after oxidative stress removal in a process well described by first-order kinetics with a tail length half-life of 11 min at 37 °C. This is, to our knowledge, the first quantitative measurement of DNA repair kinetics in S. cerevisiae by this method. We also show that diet antioxidants protect from DNA damage...

Alterations in DNA repair gene expression and their possible regulation in rat-liver regeneration

Wang,Gai-Ping; Xu,Cun-Shuan
Fonte: Sociedade Brasileira de Genética Publicador: Sociedade Brasileira de Genética
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/01/2011 Português
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66.24%
Rapidly proliferating tissue may require enhanced DNA repair capacity in order to avoid fixation of promutagenic DNA lesions to mutations. Partial hepatectomy (PH) triggers cell proliferation during liver regeneration (LR). However, little is known on how DNA repair genes change and how they are regulated at the transcriptional level during LR. In the present study, the Rat Genome 230 2.0 array was used to detect the expression profiles of DNA repair genes during LR, and differential expression of selected genes was confirmed by real-time RT-PCR. 69 DNA repair genes were found to be associated with LR, more than half of which distributed in a cluster characterized by a gradual increase at 24-72h and then returning to normal. The expression of base excision repair- and transcription-coupled repair-related genes was enhanced in the early and intermediate phases of LR, whereas the expression of genes related to HR, NHEJ and DNA cross-link repair, as well as DNA polymerases and related accessory factors, and editing or processing nucleases, were mainly enhanced in the intermediate phase. The expression changes of genes in DNA damage response were complicated throughout the whole LR. Our data also suggest that the expression of most DNA repair genes may be regulated by the cell cycle during LR.

Current Advances in DNA Repair: Regulation of Enzymes and Pathways Involved in Maintaining Genomic Stability

Neher, Tracy M.; Turchi, John J.
Fonte: Mary Ann Liebert, Inc. Publicador: Mary Ann Liebert, Inc.
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 15/06/2011 Português
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Novel discoveries in the DNA repair field have lead to continuous and rapid advancement of our understanding of not only DNA repair but also DNA replication and recombination. Research in the field transcends numerous areas of biology, biochemistry, physiology, and medicine, making significant connections across these broad areas of study. From early studies conducted in bacterial systems to current analyses in eukaryotic systems and human disease, the innovative research into the mechanisms of repair machines and the consequences of ineffective DNA repair has impacted a wide scientific community. This Forum contains a select mix of primary research articles in addition to a number of timely reviews covering a subset of DNA repair pathways where recent advances and novel discoveries are improving our understanding of DNA repair, its regulation, and implications to human disease. Antioxid. Redox Signal. 14, 2461–2464.

BRCA2: One Small Step for DNA Repair, One Giant Protein Purified

Jensen, Ryan B.
Fonte: YJBM Publicador: YJBM
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 13/12/2013 Português
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66.22%
DNA damage, malfunctions in DNA repair, and genomic instability are processes that intersect at the crossroads of carcinogenesis. Underscoring the importance of DNA repair in breast and ovarian tumorigenesis is the familial inherited cancer predisposition gene BRCA2. The role of BRCA2 in DNA double-strand break repair was first revealed based on its interaction with RAD51, a central player in homologous recombination. The RAD51 protein forms a nucleoprotein filament on single-stranded DNA, invades a DNA duplex, and initiates a search for homology. Once a homologous DNA sequence is found, the DNA is used as a template for the high-fidelity repair of the DNA break. Many of the biochemical features that allow BRCA2 to choreograph the activities of RAD51 have been elucidated and include: targeting RAD51 to single-stranded DNA while inhibiting binding to dsDNA, reducing the ATPase activity of RAD51, and facilitating the displacement of the single-strand DNA binding protein, Replication Protein A. These reinforcing activities of BRCA2 culminate in the correct positioning of RAD51 onto a processed DNA double-strand break and initiate its faithful repair by homologous recombination. In this review, I will address current biochemical data concerning the BRCA2 protein and highlight unanswered questions regarding BRCA2 function in homologous recombination and cancer.

A Role for the human Rad9-Rad1-Hus1 DNA clamp complex in DNA repair

Brandt, Patrick D. (1976 - ); Bambara, Robert A.
Fonte: Universidade de Rochester Publicador: Universidade de Rochester
Tipo: Tese de Doutorado Formato: Number of Pages:xviii, 133 leaves
Português
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66.27%
Thesis (Ph. D.)--University of Rochester. School of Medicine and Dentistry. Dept. of Biochemistry & Biophysics, 2007.; The human proteins Rad9, Rad1, and Hus1 assemble to form a DNA clamp known as the 9-1-1 complex. The 9-1-1 complex plays an essential role in DNA damage recognition and in cell cycle checkpoint signaling. 9-1-1 is structurally similar to proliferating cell nuclear antigen (PCNA), which stimulates many DNA replication and repair enzymes. Work explained herein shows that the 9-1-1 complex stimulates DNA repair enzymes in addition to its role in damage recognition and checkpoint signaling. Using purified human proteins we showed that 9-1-1 stimulates flap endonuclease 1 (FEN1), an endonuclease responsible for removing single stranded DNA flaps that arise during DNA replication and repair processes. FEN1 stimulation by 9-1-1 was observed on all flap lengths and configurations tested. We also showed that FEN1 and Rad1 coimmunoprecipitate. Consistent with the hypothesis that 9-1-1 is operative in DNA repair pathways, but not necessarily DNA replication, 9-1-1 does not stimulate the replicative DNA polymerase δ. We employed a human cell model to examine the effect of Rad9 knockdown on cellular phenotype. We showed that cells depleted of Rad9 exhibit decreased survival following ionizing radiation (IR) and that they require more time to exit IR-induced G2 phase arrest. Using the comet assay...

DNA repair gene polymorphisms and prostate cancer risk in South Australia-results of a pilot study

Dhillon, Varinderpal; Yeoh, Eng Kiat; Fenech, Michael Felix
Fonte: Elsevier Publicador: Elsevier
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em //2011 Português
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66.21%
Objective: Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in DNA repair genes may impact on DNA damage, and cancer risk. To elucidate the role of SNPs in DNA repair genes in prostate cancer (PC) we conducted a case-control study comprising of 118 Caucasian men affected with late onset PC and 132 age-matched healthy controls from South Australia. Methods and materials: We examined the association between PC risk with nonsynonymous SNPs (nsSNPs) in 5 genes involved in 3 DNA-repair pathways: (1) base excision repair (BER): hOGG1 C1245G (Ser326Cys) and XRCC1 G28152A (Arg399Gln); (2) nucleotide excision repair (NER): XPD G23591A (Asp312Asn); (3) homologous recombination repair: RAD51 G135C (in 5′ untranslated region) and XRCC3 C18067T (Thr241Met). Results: Prostate cancer risk was significantly increased only for carriers of the G allele of the C1245G polymorphism in the hOGG1 gene (OR = 2.28; 95% CI = 1.36–3.83; P = 0.002). Conclusion: Our results suggest that this common nsSNP in a gene involved in repair of oxidative damage to DNA may contribute to PC susceptibility in South Australian men.; Varinderpal S. Dhillon M., Eric Yeoh and Michael Fenech

Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma; Identification of variants in the DNA sequence of patients deficient in DNA repair processes

Moura, Livia Maria Silva
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 08/10/2015 Português
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66.19%
Apesar de altamente estável, o DNA sofre milhares de alterações em sua estrutura diariamente, sejam essas espontâneas ou pela exposição a agentes mutagênicos. A maior parte dessas alterações é prontamente removida por um conjunto de eventos de reparo de DNA. A via de reparo por excisão de nucleotídeos (NER) é a mais versátil e flexível lidando com uma variedade de lesões que podem gerar distorções das hélices do DNA. Esses danos resultam em alterações características que, caso não reparadas, podem gerar mutações ou morte celular e, consequentemente, câncer e envelhecimento. Algumas síndromes, nas quais os pacientes são sensíveis à luz solar, estão relacionadas à deficiência no processo de NER, como a Xeroderma Pigmentosum (XP), síndrome de Cockayne (CS) e Tricotiodistrofia (TTD). Indivíduos brasileiros, incluindo pacientes com diagnóstico clínico de XP e membros das famílias, passaram por um processo in silico para a identificação variantes em genes relacionados aos processos de reparo do DNA após o sequenciamento do DNA por plataformas de nova geração (NGS: plataforma ABI 5500XL SOLiD e MiSeq Illumina) e análises de Bioinformática. Para cada paciente, foram selecionados os melhores valores de parâmetros para se realizar a busca por variantes considerando a qualidade de alinhamento e a taxa de cobertura das bases alvo. SNPs já depositados no banco de dados do projeto 1000genomes foram removidos de nossos dados. O restante das variantes foi analisado para encontrar potenciais candidatos que poderiam explicar o diagnóstico clínico do paciente. Em muitas amostras foi possível determinar pelo menos uma variante (mutação) com uma elevada possibilidade de ser responsável pelos sintomas XP. Para alguns pacientes...

Can Estuary Sediment Contaminants Interfere with the DNA Repair Capacity of HEPG2 Cells?

Pinto, Miguel; Louro, Henriqueta; Costa, Pedro Manuel; Caeiro, Sandra; SIlva, Maria João
Fonte: Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IP Publicador: Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IP
Tipo: Conferência ou Objeto de Conferência
Publicado em 18/09/2013 Português
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66.25%
Estuarine sediments tend to act as reservoirs of pollutants, many of which are acknowledged genotoxicants and potential carcinogens for humans. In addition, many of these environmental contaminants, particularly metals, have the potential to interfere with DNA repair mechanisms. Taking an impacted estuary as a case study (the Sado, SW Portugal), previous studies showed that human hepatoma cells (HepG2) exposed to extracts of sediments collected from two areas (urban/industrial and riverine/agricultural), both contaminated by distinct mixtures of organic and inorganic toxicants, revealed differential cytotoxic and genotoxic effects, consistent with contamination indices. In this context, the present study aimed at determining whether contaminants present in sediment extracts are able to interfere with the DNA repair mechanisms of HepG2 cells. Organic and inorganic contaminants were extracted (methanol:dichloromethane) from sediment samples collected in different sites of the Sado Estuary, either heavily impacted by an urban/industrial environment (site P) or by agriculture (sites E and A); a sediment collected in a potentially “clean” site was also included (site C). The repair capacity of HepG2 cells towards ethyl methanesulfonate (EMS...

Biotransformation and DNA Repair in 4-(Methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone-Induced Pulmonary Carcinogenesis

Brown, PAMELA
Fonte: Quens University Publicador: Quens University
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 718454 bytes; application/pdf
Português
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66.22%
Studies described in this thesis were at aimed at characterizing the mechanisms involved in the pulmonary carcinogenicity of the tobacco-specific nitrosamine, 4-(methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone (NNK), by addressing two critical determinants of carcinogenicity; biotransformation and DNA repair. The contributions of cytochrome P450 (CYP) 2A13 and CYP2A6 to NNK biotransformation in human lung microsomes were investigated. Based on total bioactivation and detoxification of NNK and its keto-reduced metabolite, 4 (methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanol (NNAL), subjects could be classified as either high or low bioactivators and detoxifiers. Data from all of 29 individuals revealed no correlations between levels of CYP2A mRNA, enzyme activity or immunoinhibition and the degree of total NNK bioactivation or detoxification. However, subgroups were identified for whom CYP2A13 mRNA correlated with total NNK and NNAL bioactivation (n=4) and NNAL detoxification (n=5). Although results do not support CYP2A13 or CYP2A6 as predominant contributors to NNK metabolism in lung of all individuals, CYP2A13 appears to be important in some. The involvement of nucleotide excision repair (NER) in the repair of NNK-induced DNA pyridyloxobutylation was assessed. Extracts from NER-deficient cells were less active at repairing pyridyloxobutyl (POB) adducts on plasmid DNA than were extracts from normal cells...

Inhibitor of growth 1 (ING1) acts at early steps of multiple DNA repair pathways

Ceruti, Julieta María; Ogara, Maria Florencia; Menéndez, Camino; Palmero, Ignacio; Canepa, Eduardo Tomas
Fonte: Springer Publicador: Springer
Tipo: info:eu-repo/semantics/article; info:ar-repo/semantics/artículo; info:eu-repo/semantics/publishedVersion Formato: application/pdf
Português
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ING proteins are tumor suppressors involved in the regulation of gene transcription, cell cycle arrest, apoptosis, and senescence. Here, we show that ING1b expression is upregulated by several DNA-damaging agents, in a p53-independent manner. ING1b stimulates DNA repair of a variety of DNA lesions requiring activation of multiple DNA repair pathways. Moreover, Ing1 −/− cells showed impaired genomic DNA repair after H2O2 and neocarzinostatin treatment and this defect was reverted by overexpression of ING1b. Two tumor-derived ING1 mutants failed to promote DNA repair highlighting the physiological importance of the integrity of the PHD domain for ING1b DNA repair activity and suggesting a role in the prevention of tumor progression. Ing−/− cells showed higher basal levels of γ-H2AX and, upon DNA damage, γ-H2AX increase was greater and with faster kinetics compared to wild-type cells. Chromatin relaxation by Trichostatin A led to an exacerbated damage signal in both types of cells, but this effect was dependent on Ing1 status, and more pronounced in wild-type cells. Our results suggest that ING1 acts at early stages of the DNA damage response activating a variety of repair mechanisms and that this function of ING1 is targeted in tumors.; Fil: Ceruti...