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Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli; A genomic approach for the understanding of the fastidious behavior of Leifsonia xyli subsp. xyli

Rosa, Daniel Dias
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 02/10/2006 Português
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36.67%
A cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) é uma das mais importantes culturas agrícolas. Cultivada em mais de 127 países, a cultura se apresenta como um dos alicerces para a socioeconomia e cultura de muitas regiões do Brasil e do mundo. Sua produtividade depende de diversos fatores, sendo esses atendidos pela intensa hibridação interespecífica visando principalmente à obtenção de cultivares mais produtivas, precoces e resistentes a diversos tipos de estresses. Entre os estresses, os causados por microorganismos são os mais relevantes e, dentre estes, destaca-se o agente causal da doença raquitismo da soqueira da cana-de-açúcar, a bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx). O estudo mais aprofundado sobre esta relação patógenohospedeiro é difícil, visto que Lxx é uma bactéria fastidiosa de difícil cultivo. O sequenciamento completo de seu genoma abriu a oportunidade de se entender às causas fisiológicas da dificuldade do seu cultivo. Assim, os objetivos deste trabalho foram otimizar um meio de cultura para Lxx com base em análise de vias metabólicas importantes e estudar a expressão diferencial de seus genes quando esta é cultivada na presença e ausência de metionina. Análises bioinformáticas do genoma de Lxx indicaram que esta está apta a utilizar diversas fontes de carbono...

Influência do regime hídrico na infecção de plantas cítricas jovens por Xylella fastidiosa; Influence of water regime in the infection of young citrus plants by Xylella fastidiosa

Cava, Cristiane Ramos da Veiga Lima
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/02/2007 Português
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26.36%
Cerca de 38% das árvores cítricas do Estado de São Paulo são afetadas pela Clorose Variegada dos Citros - CVC, causando perdas anuais de cerca de 100 milhões de dólares para as indústrias citrícolas. O agente causal da CVC é uma bactéria gram-negativa, fastidiosa e habitante dos vasos de xilema denominada Xylella fastidiosa, transmitida por cigarrinhas pertencentes à família Cicadellidae, subfamília Cicadellinae. Já foi observado que laranjas doces jovens, na faixa de 3 a 4 anos de idade, são mais sensíveis à CVC do que as plantas adultas. A doença é mais severa em regiões onde estresses adicionais ocorrem, como alta demanda atmosférica por água (decorrente do aumento da temperatura e do déficit de pressão de vapor) e déficit hídrico no solo. Os mecanismos fisiológicos e químicos que caracterizam o estabelecimento da CVC ainda não foram totalmente compreendidos, especialmente sob condições de estresse. Sendo assim, estudos que consideram a interação entre época do ano, regime hídrico e o estabelecimento da CVC em plantas jovens são necessários para auxiliar na elaboração de programas de manejo da doença. O presente trabalho avaliou a sobrevivência de infecções iniciais de X. fastidiosa em plantas cítricas jovens no campo...

Análise do proteoma e do sistema antioxidante de cana-de-açúcar em resposta à colonização por Leifsonia xyli subsp. xyli, agente causal do raquitismo-das-soqueiras; Proteome and antioxidant system analysis of sugarcane in response to Leifsonia xyli subsp. xyli, causal agent of ratoon stunting disease

Carvalho, Giselle de
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 17/08/2012 Português
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26.53%
A cana-de-açúcar, é atualmente a cultura mais plantada no estado de São Paulo, apresentando grande importância no setor agrícola. Assim como qualquer outra cultura, é hospedeira de uma série de patógenos que podem limitar sua produção. A bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) é o agente causal do raquistismo-das-soqueiras (RSD) em canade- açúcar cujo o principal sintoma é a redução acentuada do crescimento observada em plantas adultas. Essa doença é de difícil diagnose pois a evolução dos sintomas é lenta devido à natureza fastidiosa da bactéria. Lxx pode ser considerada como um endófíto obrigatório que cresce a níveis patogênicos nos tecidos da planta dependendo de estímulos bióticos e abióticos. Devido à importância da cultura e aos danosoCasionados pela Lxx, este trabalho apresentou dois enfoques principais: o primeiro foi o desenvolvimento de um protocolo para quantificação de Lxx em tecido de cana-de-açúcar por meio da técnica de PCR quantitativo em tempo real; o segundo foi o estudo da interação entre cana-de-açúcar e Lxx, em busca de uma melhor compreensão da evolução desse processo através da identificação de proteínas que apresentaram alteração em abundância ao longo do tempo em função da colonização pela bactéria em duas variedades de cana (RB835486 e SP80-3280) e em seguida enfatizando o sistema antioxidante nesta relação. Para isso...

Termoterapia associada à cultura de tecidos para obtenção de plantas de cana-de-açúcar da variedade SP80-3280 livres de Leifsonia xyli subsp. xyli; Thermotherapy associated to tissue culture to obtain sugarcane plants of variety SP80-3280 free from Leifsonia xyli subsp. xyli

Chaddad, Martha Monteiro
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 15/04/2013 Português
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26.28%
A cana-de-açúcar é uma das principais culturas agroindustriais do Brasil. Como outras culturas de importância econômica, é também afetada por diversos patógenos como fungos, bactérias, vírus e fitoplasmas que podem limitar sua produção. A bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) é o agente causal do raquitismo-da-soqueira da cana-de-açúcar (RSD). Esta doença não apresenta sintomas externos característicos de fácil reconhecimento. Dessa forma, a incidência do RSD pode não ser perceptível durante inspeções visuais de campo e, assim, ser facilmente disseminado de uma região para outra. A bactéria restrita ao xilema é transmitida mecanicamente de plantas infectadas para plantas saudáveis por meio da seiva presente em ferramentas de corte e em outros equipamentos durante o plantio, o cultivo e a colheita da cultura. Em razão da importância da cana-de-açúcar e do dano causado por Lxx, este trabalho visou avaliar a termoterapia e o cultivo in vitro em dois experimentos direcionados à obtenção de plantas de cana-de-açúcar da variedade SP80-3280 livres de Leifsonia xyli subsp. xyli e, assim, fornecer subsídio para o aprimoramento das medidas atuais de controle. O primeiro experimento combinou a termoterapia de toletes de uma gema (52 °C por 30 minutos) com o cultivo de meristemas apicais de três tamanhos (0...

Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes; Ratoon stunting disease of sugarcane: seed transmission of the pathogen and quantitative evaluation of its control through heat treatment of setts

Silva, Thaís Galhardo Egreja Ribeiro da
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 06/12/2013 Português
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26.36%
Devido à sua múltipla utilidade, a cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é amplamente cultivada em mais de 127 países tropicais e subtropicais. No Brasil, a cultura apresentou expansão em área plantada nos últimos anos em virtude da crescente demanda por biocombustíveis. Porém, a produção de mudas sadias tende a ser um fator limitante a este aumento de demanda, já que diversas doenças são transmitidas por toletes contaminados. Dentre estas, destaca-se o raquitismo da soqueira (RSD), causado pela bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) (KAO e DAMANN, 1980). De acordo com a literatura, a transmissão de Lxx se dá através de toletes contaminados e/ou instrumentos de corte, não havendo relatos sobre sua transmissão por sementes. Desta forma, seu controle se baseia no princípio da exclusão, através do uso de toletes tratados termicamente como fonte de material propagativo. Porém, não se conhece o efeito do tratamento no título de Lxx, uma vez que os relatos de eficiência da termoterapia baseiam-se em avaliações qualitativas. Em face destas informações, este estudo objetivou avaliar a transmissão de Leifsonia xyli subsp. xyli por sementes e também quantificar o efeito da termoterapia no título de Lxx em duas variedades de cana-de-açúcar através da PCR quantitativa em tempo real. No ensaio de transmissão via sementes...

Seleção de plantas hospedeiras experimentais para ensaios de transmissão da estirpe de citros de Xylella fastidiosa; Selection of experimental host plants for transmission tests of citrus strain of Xylella fastidiosa

Esteves, Mariana Bossi
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/01/2015 Português
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36.28%
A clorose variegada dos citros (CVC) é uma das principais doenças que afeta a citricultura brasileira, causada pela bactéria Xylella fastidiosa (Wells), que coloniza o xilema de culturas de interesse econômico, além de plantas ornamentais e daninhas, sendo transmitida por cigarrinhas (Hemiptera: Cicadellidae: Cicadellinae). A compreensão do patossistema CVC é fundamental para planejar táticas eficazes de controle da doença. Entretanto, as pesquisas sobre interações patógeno-planta-vetores são escassas, devido à falta de plantas hospedeiras adequadas para ensaios de transmissão da bactéria, visto que citros não é um bom hospedeiro experimental. Assim, nesta pesquisa objetivou-se identificar espécies herbáceas que permitam a colonização sistêmica da estirpe de X. fastidiosa de citros, e avaliar seu uso como plantas-fonte e plantas-teste (indicadoras) em testes de transmissão por Bucephalogonia xanthophis (Berg). Para tal foram escolhidas as plantas Bidens pilosa L., Catharanthus roseus L., Citrus sinensis (L.) Osbeck, Medicago sativa L., Nicotiana tabacum L., Ocimum basilicum L., Parthenium hysterophorus L., Phaseolus vulgaris L., Sida rhombifolia L. e Solanum americanum Mill, que foram inoculadas mecanicamente com isolados de X. fastidiosa de citros e posteriormente avaliadas quanto à infecção por isolamento primário e reação de cadeia da polimerase (PCR). As espécies que permitiram colonização bacteriana foram posteriormente avaliadas em experimentos de transmissão por B. xanthophis...

Floating Filters, a Novel Technique for Isolation and Enumeration of Fastidious, Acidophilic, Iron-Oxidizing, Autotrophic Bacteria

de Bruyn, Johanna C.; Boogerd, Fred C.; Bos, Pieter; Kuenen, J. Gijs
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /09/1990 Português
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26.37%
Nuclepore polycarbonate filters floating on a liquid, FeSO4-containing medium (pH 1.6) were used to isolate a moderately thermophilic bacterium from a pyrite-oxidizing enrichment culture. The isolate failed to grow on any of the conventional solid media tried. To test the general applicability of the method, the enumeration of a fastidious acidophilic organism, Thiobacillus ferrooxidans, was carried out and the results compared with those obtained with other filters, solid media, and the most probable number technique. T. ferrooxidans showed better viability on the floating polycarbonate filters and grew in a much shorter time (4 to 5 days) than with the other techniques.

Methanogenesis from acetate: a nonmethanogenic bacterium from an anaerobic acetate enrichment.

Ward, D M; Mah, R A; Kaplan, I R
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /06/1978 Português
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26.36%
A methanogenic acetate enrichment was initiated by inoculation of an acetate-mineral salts medium with domestic anaerobic digestor sludge and maintained by weekly transfer for 2 years. The enrichment culture contained a Methanosarcina and several obligately anaerobic nonmethanogenic bacteria. These latter organisms formed varying degrees of association with the Methanosarcina, ranging from the nutritionally fastidious gram-negative rod called the satellite bacterium to the nutritionally nonfastidious Eubacterium limosum. The satellite bacterium had growth requirements for amino acids, a peptide, a purine base, vitamin B12, and other B vitamins. Glucose, mannitol, starch, pyruvate, cysteine, lysine, leucine, isoleucine, arginine, and asparagine stimulated growth and hydrogen production. Acetate was neither incorporated nor metabolized by the satellite organism. Since acetate was the sole organic carbon source in the enrichment culture, organism(s) which metabolize acetate (such as the Methanosarcina) must produce substrates and growth factors for associated organisms which do not metabolize acetate.

Enhancement of experimental bacteremia and endocarditis caused by dysgonic fermenter (DF-2) bacterium after treatment with methylprednisolone and after splenectomy.

Butler, T; Johnston, K H; Gutierrez, Y; Aikawa, M; Cardaman, R
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /01/1985 Português
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26.36%
The dysgonic fermenter-2 bacterium is a newly recognized fastidious gram-negative bacillus that causes bacteremia and sometimes endocarditis in immunocompromised persons after they are bitten by dogs. To develop an experimental model of this infection, we placed polyethylene catheters across the aortic valves of New Zealand white rabbits, which were inoculated intravenously the next day with dysgonic fermenter-2 bacteria. After 1 week, the rabbits were killed and the endocardial vegetations were homogenized for quantitative culture. Large inocula (1.3 X 10(10) to 2.1 X 10(10) viable bacteria) were required to produce infected vegetations. All infected rabbits had negative blood cultures at the time of autopsy and most developed serum agglutinins against dysgonic fermenter-2 bacteria. Three daily injections of methylprednisolone (30 mg/kg), starting the day before inoculation, significantly increased the incidence of endocarditis and the number of bacteria per gram of infected vegetation (P less than 0.05). Treatment with methylprednisolone prolonged the initial bacteremia and caused significant increases in the numbers of bacteria per gram of blood, spleen, and liver compared with those of untreated controls (P less than 0.05). Rabbits that had previously undergone splenectomy showed prolongation of the initial bacteremia but no significant increase in the incidence of infected vegetations. These results showed that the dysgonic fermenter-2 bacterium is a pathogen that causes endocarditis in rabbits but that it requires a large inoculum and produces blood culture-negative infections. Treatment with methylprednisolone enhances infection by prolonging the initial bacteremia and probably by diminishing bactericidal activity in the vegetations.

Multispacer Typing Technique for Sequence-Based Typing of Bartonella quintana

Foucault, C.; La Scola, B.; Lindroos, H.; Andersson, S. G. E.; Raoult, D.
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /01/2005 Português
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26.28%
Bartonella quintana is a worldwide fastidious bacterium of the Alphaproteobacteria responsible for bacillary angiomatosis, trench fever, chronic lymphadenopathy, and culture-negative endocarditis. The recent genome sequencing of a B. quintana isolate allowed us to propose a genome-wide sequence-based typing method. To ensure sequence discrimination based on highly polymorphic areas, we amplified and sequenced 34 spacers in a large collection of B. quintana isolates. Six of these exhibited polymorphisms and allowed the characterization of 4 genotypes. However, the strain variants suggested by the noncoding sequences did not correlate with the results of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), which suggested a higher degree of variability. Modification of the PFGE profile of one isolate after nine subcultures confirmed that rearrangement frequencies are high in this species, making PFGE unreliable for epidemiological purposes. The low extent of sequence heterogeneity in the species suggests a recent emergence of this bacterium as a human pathogen. Direct typing of natural samples allowed the identification of a fifth genotype in the DNA extracted from a human body louse collected in Burundi. We have named the typing technique herein described multispacer typing.

Cultivation of Fastidious Bacteria by Viability Staining and Micromanipulation in a Soil Substrate Membrane System▿

Ferrari, B. C.; Gillings, M. R.
Fonte: American Society for Microbiology (ASM) Publicador: American Society for Microbiology (ASM)
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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26.37%
Soil substrate membrane systems allow for microcultivation of fastidious soil bacteria as mixed microbial communities. We isolated established microcolonies from these membranes by using fluorescence viability staining and micromanipulation. This approach facilitated the recovery of diverse, novel isolates, including the recalcitrant bacterium Leifsonia xyli, a plant pathogen that has never been isolated outside the host.

Detection of Fastidious Vaginal Bacteria in Women with HIV Infection and Bacterial Vaginosis

Mitchell, Caroline; Moreira, Carla; Fredricks, David; Paul, Kathleen; Caliendo, Angela M.; Kurpewski, Jaclynn; Ingersoll, Jessica; Cu-Uvin, Susan
Fonte: Hindawi Publishing Corporation Publicador: Hindawi Publishing Corporation
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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26.75%
Background. Fastidious bacteria have been associated with bacterial vaginosis (BV) using PCR methods. We assessed the prevalence of these bacteria in HIV-1 infected women and their relationship with vaginal pH and shedding of HIV-1 RNA. Methods. 64 cervicovaginal lavage (CVL) samples were collected from 51 women. Vaginal microbiota were characterized using 8 bacterium-specific quantitative PCR assays. Results. Women with the fastidious bacteria Bacterial Vaginosis Associated Bacterium (BVAB) 1, 2, and 3 showed a trend to increased HIV-1 shedding (OR 2.59–3.07, P = .14–.17). Absence of Lactobacillus crispatus (P < .005) and presence of BVAB2 (P < .001) were associated with elevated vaginal pH. BVAB1, 2, and 3 were highly specific indicators of BV in HIV-infected women, with specificities of 89%–93%. Conclusions. Fastidious bacteria (BVAB 1, 2, and 3) remain specific indicators of BV in HIV-infected women, and BVAB2 may contribute to the elevated vaginal pH that is a hallmark of this syndrome.

Sexual Transmission of a Plant Pathogenic Bacterium, Candidatus Liberibacter asiaticus, between Conspecific Insect Vectors during Mating

Mann, Rajinder S.; Pelz-Stelinski, Kirsten; Hermann, Sara L.; Tiwari, Siddharth; Stelinski, Lukasz L.
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 21/12/2011 Português
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26.45%
Candidatus Liberibacter asiaticus is a fastidious, phloem-inhabiting, gram-negative bacterium transmitted by Asian citrus psyllid, Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Psyllidae). The bacterium is the presumed causal agent of huanglongbing (HLB), one of the most destructive and economically important diseases of citrus. We investigated whether Las is transmitted between infected and uninfected D. citri adults during courtship. Our results indicate that Las was sexually transmitted from Las-infected male D. citri to uninfected females at a low rate (<4%) during mating. Sexual transmission was not observed following mating of infected females and uninfected males or among adult pairs of the same sex. Las was detected in genitalia of both sexes and also in eggs of infected females. A latent period of 7 days or more was required to detect the bacterium in recipient females. Rod shaped as well as spherical structures resembling Las were observed in ovaries of Las-infected females with transmission electron microscopy, but were absent in ovaries from uninfected D. citri females. The size of the rod shaped structures varied from 0.39 to 0.67 µm in length and 0.19 to 0.39 µm in width. The spherical structures measured from 0.61 to 0.80 µm in diameter. This investigation provides convincing evidence that a plant pathogenic bacterium is sexually transmitted from male to female insects during courtship and established evidence that bacteria persist in reproductive organs. Moreover...

Diagnosis of Helicobacter pylori: What should be the gold standard?

Patel, Saurabh Kumar; Pratap, Chandra Bhan; Jain, Ashok Kumar; Gulati, Anil Kumar; Nath, Gopal
Fonte: Baishideng Publishing Group Inc Publicador: Baishideng Publishing Group Inc
Tipo: Artigo de Revista Científica
Português
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26.42%
Since the discovery of Helicobacter pylori (H. pylori) in 1983, numerous detection methods for the presence of the bacterium have been developed. Each one of them has been associated with advantages and disadvantages. Noninvasive tests such as serology, 13C urea breath test (UBT) and stool antigen tests are usually preferred by the clinicians. Serology has its own limitation especially in endemic areas while 13C UBT is technically very demanding. The stool antigen detection method, although specific, is usually associated with poor sensitivity. The 13C UBT is believed to be specific, but with present revelation of the fact that stomach is colonized by many other urease producing bacteria makes it questionable. Histology, culture, rapid urease test and polymerase chain reaction (PCR) are the tests which are carried out on antral biopsies collected by invasive means. Histology has been proposed to be very sensitive and specific but the question is how by simply looking the morphology of the bacteria in the microscope, one can claim that the curved bacterium is exclusively H. pylori. Rapid urease test (RUT), the doctor’s test, is also challenged because the presence of other urease producing bacteria in the stomach cannot be denied. Moreover...

Development of a Markerless Deletion System for the Fish-Pathogenic Bacterium Flavobacterium psychrophilum

Gómez, Esther; Álvarez, Beatriz; Duchaud, Eric; Guijarro, José A.
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 18/02/2015 Português
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36.42%
Flavobacterium psychrophilum is a Gram-negative fish pathogen that causes important economic losses in aquaculture worldwide. Although the genome of this bacterium has been determined, the function and relative importance of genes in relation to virulence remain to be established. To investigate their respective contribution to the bacterial pathogenesis, effective tools for gene inactivation are required. In the present study, a markerless gene deletion system has been successfully developed for the first time in this bacterium. Using this method, the F. psychrophilum fcpB gene, encoding a predicted cysteine protease homologous to Streptococcus pyogenes streptopain, was deleted. The developed system involved the construction of a conjugative plasmid that harbors the flanking sequences of the fcpB gene and an I-SceI meganuclease restriction site. Once this plasmid was integrated in the genome by homologous recombination, the merodiploid was resolved by the introduction of a plasmid expressing I-SceI under the control of the fpp2 F. psychrophilum inducible promoter. The resulting deleted fcpB mutant presented a decrease in extracellular proteolytic activity compared to the parental strain. However, there were not significant differences between their LD50 in an intramuscularly challenged rainbow trout infection model. The mutagenesis approach developed in this work represents an improvement over the gene inactivation tools existing hitherto for this “fastidious” bacterium. Unlike transposon mutagenesis and gene disruption...

Generating Isogenic Deletions (Knockouts) in Francisella tularensis, a Highly-infectious and Fastidious Gram-negative Bacterium

Wu, Xiaojun; Ren, Guoping; Huntley, Jason F.
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 20/06/2015 Português
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26.37%
Generating bacterial gene deletion mutants, also known as knockouts (KOs), is a powerful tool to investigate individual gene functions. However, fastidious bacteria such as Francisella tularensis (F. tularensis) often are difficult to genetically manipulate. Indeed, many different approaches have been tested to generate F. tularensis mutants. First, Tn5-based EZ::TN transposons have been successfully used to generate transposon libraries in F. tularensis (Qin and Mann, 2006; Weiss et al., 2007). However, creating a comprehensive transposon library with saturating mutations can be laborious, screening for gene disruption requires high-throughput assays where known phenotypes can be measured, and transposons may not completely inactivate the gene of interest or may alter downstream gene expression. Second, group II introns (also referred to as Targetron) have been used to inactivate F. tularensis genes of interest (Rodriguez et al., 2008; Rodriguez et al., 2009). Targetron functions by forming a complex between plasmid-encoded RNA and chromosomal DNA, followed by group II intron insertion into the gene of interest. The main advantage of Targetron is that it does not require an antibiotic resistance marker. However, as noted for transposons...

Endocarditis Due to Rare and Fastidious Bacteria

Brouqui, P.; Raoult, D.
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /01/2001 Português
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26.51%
The etiologic diagnosis of infective endocarditis is easily made in the presence of continuous bacteremia with gram-positive cocci. However, the blood culture may contain a bacterium rarely associated with endocarditis, such as Lactobacillus spp., Klebsiella spp., or nontoxigenic Corynebacterium, Salmonella, Gemella, Campylobacter, Aeromonas, Yersinia, Nocardia, Pasteurella, Listeria, or Erysipelothrix spp., that requires further investigation to establish the relationship with endocarditis, or the blood culture may be uninformative despite a supportive clinical evaluation. In the latter case, the etiologic agents are either fastidious extracellular or intracellular bacteria. Fastidious extracellular bacteria such as Abiotrophia, HACEK group bacteria, Clostridium, Brucella, Legionella, Mycobacterium, and Bartonella spp. need supplemented media, prolonged incubation time, and special culture conditions. Intracellular bacteria such as Coxiella burnetii cannot be isolated routinely. The two most prevalent etiologic agents of culture-negative endocarditis are C. burnetti and Bartonella spp. Their diagnosis is usually carried out serologically. A systemic pathologic examination of excised heart valves including periodic acid-Schiff (PAS) staining and molecular methods has allowed the identification of Whipple's bacillus endocarditis. Pathologic examination of the valve using special staining...

Brachyspira pilosicoli bloodstream infections: Case report and review of the literature

Bait-Merabet, Lilia; Thille, Arnaud; Legrand, Patrick; Brun-Buisson, Christian; Cattoir, Vincent
Fonte: BioMed Central Publicador: BioMed Central
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 25/09/2008 Português
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26.53%
Brachyspira pilosicoli is the etiologic agent of human and animal intestinal spirochetosis and is rarely implicated as a cause of bacteremia. Here, we describe the case of a B. pilosicoli spirochetemia in a 53-year-old male patient suffering from cardiogenic shock. This fastidious bacterium was isolated from blood, likely after translocation from the intestinal tract. Blood cultures were positive after 5 days of incubation (one day after the patient's death), highlighting the problem of the recovery of such type of fastidious bacterium. Identification was achieved by molecular methods (16S rRNA sequencing). A review of the English literature found only 8 cases of bacteremia caused by B. pilosicoli, mostly in immunocompromised or critically ill patients. Finally, difficulties in rapid and accurate diagnosis of B. pilosicoli bloodstream infections, in vitro antimicrobial susceptibility of human clinical isolates, and therapeutic options are discussed.

Complete Genome Sequences for Two Strains of a Novel Fastidious, Partially Acid-Fast, Gram-Positive Corynebacterineae Bacterium, Derived from Human Clinical Samples

Nicholson, Ainsley C.; Bell, Melissa; Humrighouse, Ben W.; McQuiston, John R.
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Text
Publicado em 10/12/2015 Português
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26.37%
Here we report the complete genome sequences of two strains of the novel fastidious, partially acid-fast, Gram-positive bacillus “Lawsonella clevelandensis” (proposed). Their clinical relevance and unusual growth characteristics make them intriguing candidates for whole-genome sequencing.

The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa: The Xylella fastidiosa consortium of the organization for nucleotide sequencing and analysis, Sao Paulo, Brazil

Simpson, A. J G; Reinach, F. C.; Arruda, P.; Abreu, F. A.; Acencio, M.; Alvarenga, R.; Alves, L. M C; Araya, J. E.; Baia, G. S.; Baptista, C. S.; Barros, M. H.; Bonaccorsi, E. D.; Bordin, S.; Bové, J. M.; Briones, M. R S; Bueno, M. R P; Camargo, A. A.; C
Fonte: Macmillan Publishers Ltd Publicador: Macmillan Publishers Ltd
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 151-157
Português
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26.48%
Xylella fastidiosa is a fastidious, xylem-limited bacterium that causes a range of economically important plant diseases. Here we report the complete genome sequence of X. fastidiosa clone 9a5c, which causes citrus variegated chlorosis - a serious disease of orange trees. The genome comprises a 52.7% GC-rich 2,679,305-base-pair (bp) circular chromosome and 'two plasmids of 51,158 bp and 1,285 bp. We can assign putative functions to47% of the 2,904 predicted coding regions. Efficient metabolic functions are predicted, with sugars as the principal energy and carbon source, supporting existence in the nutrient-poor xylem sap. The mechanisms associated with pathogenicity and virulence involve toxins, antibiotics and ion sequestration systems, as well as bacterium-bacterium and bacterium-host interactions mediated by a range of proteins. Orthologues of some of these proteins have only been identified in animal and human pathogens; their presence in X. fastidiosa indicates that the molecular basis for bacterial pathogenicity is both conserved and independent of host. At least 83 genes are bacteriophage-derived and include virulence-associated genes from other bacteria, providing direct evidence of phage-mediated horizontal gene transfer.